为什么bioRxiv不能成为中央服务

因此,这再次发生了,在Twitter上又有关于预印本中央服务的讨论,人们再次问为什么bioRxiv还不是中央服务。

我已经在这里和这是最后一次发生此问题,写了两篇博客文章,但是我主要关注于对开放科学中心的关注,仅简要谈到了bioRxiv的问题。 我想第三次很吸引人,并且为了确保没有必要发表第四篇文章,我将尽力弄清楚bioRxiv的问题。

1. BioRxiv软件不是开源的

由于BioRxiv已获得HighWire Press平台的许可,因此立即被取消其作为中央服务的资格。 ASAPbio在他们的提案中明确指出,中央服务的所有技术都必须是开源的。

2.不兼容的许可证

当您向bioRxiv提交预印本时,您可以选择几种许可证,包括“保留所有权利”。 Daniel Himmelstein和我之前在bioRxiv上分析了许可证的选择,发现30%为“保留所有权利”。

对于中央服务部门来说,这是个问题,因为这意味着这些预印本无法分发,甚至不能由第三方存档。 这些带有限制性许可的预印本将如何在中央服务中进行归档是一个悬而未决的问题。 第三方是否能够通过短信发送这些文章也是一个悬而未决的问题。

3.无标准

中央服务的目标之一是建立预印本标准,包括确保完整的元数据。 我以前使用过这张图片,但是足够荒谬了,无法再次发布。

这是通过bioRxiv筛选过程的预印本。 我认为它是由Aaron Ellison提交的,因为他是列出姓名的唯一作者,也是查看元数据时列出电子邮件的唯一作者。

这些其他作者是谁?

我们应该如何识别它们?

它们甚至存在吗?

当您在PeerJ提交预印本时,每个作者都必须创建一个帐户,并且在提交预印本时,每个人都会收到一封电子邮件,就像在日记本上一样。 bioRxiv的提交系统比掠夺性期刊更宽松。 我现在可以立即向bioRxiv提交预印本,并列出一堆虚构人物作为作者,没有人会注意到。 甚至更糟的是,博士生可能会在导师未收到通知的情况下发布预印本。

4.政策不明确

尚不清楚bioRxiv接受或不接受哪种类型的文章。 有时他们会进行评论,有时则不会。 有时他们会接受很多作者的文章,有时他们不会。

以及他们关于收回物品的政策是什么? 他们过去删除了文章,但是他们没有留下任何原因,只是一个死链接。 我知道这一点是因为我已经索引了不再可用的文章。 看来,一位作者多次提交了非常相似的文章,多余的文章被删除了。 目前尚不清楚这是否是bioRxiv与作者之间的共同决定。 还不清楚为什么bioRxiv在筛选过程中没有捕获到类似的提交。

5.糟糕的软件

我已经提到过bioRxiv平台由于是专有服务而被取消了其中央服务的资格,但是即使它是开源的,我仍然不希望它成为中央服务。 如果您将bioRxiv与PeerJ的用户体验进行比较,那是无可争辩的。

我一直听到的bioRxiv的优点之一是该站点始终处于启动状态。 可能是这样,但是预印本并不总是可用。 从错误日志中可以看到,在每日索引编制过程中,有时会遇到“访问被拒绝”页面或“ 500内部服务器错误”。

6.缺少元数据

这在某种程度上是一个小问题,但仍然是一个问题。 由于某种原因最初张贴bioRxiv预印本时,缺少主题区域。 结果,当我对bioRxiv预印本进行每日索引时,我会错过主题信息,如果我真的想要它,我必须回去在以后重新编印预印本。 我认为这是HighWire平台的问题。 但是bioRxiv甚至知道这是一个问题吗? 他们甚至不知道自己的软件如何工作,因此不太可能。